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Porque é que a modelação de medicamentos é distribuída nos computadores das pessoas normais?

Existem alguns projectos de computação distribuída na Internet que tentam encontrar cura para doenças, como o World Community Grid . Alguém pode dizer porque é que existem tais coisas e qual a sua utilidade? Quero dizer, acredito que se você é um investigador sério, penso que é capaz de usar as redes da universidade ou supercomputadores para fazer modelação. Então, qual é a ideia de difundir a modelização nos computadores normais? Será que a modelização dos medicamentos exige tanto poder informático que os computadores das universidades não têm poder informático suficiente?

Respostas (1)

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2018-11-07 11:22:05 +0000

Não sei até que ponto os supercomputadores estão facilmente disponíveis para investigadores e universidades, mas imagino que uma grande parte da resposta à sua pergunta se reduziria aos custos.

Supercomputadores vs Projectos de Computação Distribuída

O desempenho dos computadores é medido em FLOPS (Floating Point Operations Per Second) , e em Junho de 2018,&nbsp Summit , um supercomputador construído pela IBM agora a funcionar no Laboratório Nacional de Oak Ridge (ORNL) do Departamento de Energia (DOE), capturou o ponto número um para o desempenho mais rápido dos computadores em  122. 3 petaFLOPS no LINPACK benchmark onde peta é 1015. Quando comparado com os PCs domésticos, o processador de PC doméstico mais rápido possível ao custo de $2.000 fornece aproximadamente 1 teraFLOPS onde tera é 1012.

Para projectos de computação distribuída, vejamos Folding@home .

O projecto utiliza os recursos de processamento ociosos de milhares de computadores pessoais propriedade de voluntários que instalaram o software nos seus sistemas. O seu principal objectivo é determinar os mecanismos de dobragem de proteínas, que é o processo pelo qual proteínas alcançam a sua estrutura tridimensional final, e examinar as causas de desintegração proteica. Isto é de interesse académico significativo, com grandes implicações para o investigação médica em doença de Alzheimer, doença de Huntington, e muitas formas de cancro, entre outras doenças. Em menor escala, Folding@home também tenta prever uma proteína estrutura final e determinar como outras moléculas podem interagir com ela, que tem aplicações na concepção de medicamentos. Folding@home é desenvolvido e operado pelo Pande Laboratory at Stanford University

[…]

Desde o seu lançamento em Outubro 1, 2000, o Pande Lab produziu 200 artigos de investigação científica como resultado directo do Folding@home ver [https://foldingathome. org/papers-results]

As estatísticas fornecidas pelo Folding@home em https://stats.foldingathome.org/os afirmam que o seu projecto proporciona um desempenho total de 47.344 teraFLOPS nativos ou 98.747 x86 teraFLOPS.

Note que estes valores de teraFLOPS são provenientes dos núcleos de software, não os valores de pico das especificações de CPU/GPU e estes valores apenas batem o desempenho do&nbsp da China;Sunway TaihuLight em 2016 que foi classificado como o mais rápido do mundo com 93 petaFLOPS no benchmark LINPACK agora o 2º supercomputador mais rápido ).

Cost

IBMs Summit Supercomputer custou 200 milhões de dólares para construir e, segundo a Wikipedia, o Sunway TaihuLight custou 273 milhões de dólares. Quando se considera o desempenho informático fornecido pelo Folding@home é fornecido por voluntários (por isso o sistema é gratuito), é um “no brainer” que o poder computacional em oferta não deve ser recusado.